Monday, September 21, 2015

Rietveld Software: GSAS

according to Dr. Toby, there are dozens of software.

But of the people they surveyed, 3/4 are using GSAS.  Certainly, it is developed by a group of smart people and it belongs to our government, i.e. you can use it free of charge.  so "i don't have money" is not an excuse anymore.

here is the full blown intro by Dr, Toby

http://www.aps.anl.gov/Xray_Science_Division/Powder_Diffraction_Crystallography/4GSASEXPGUIintro/4GSASEXPGUIintro.html
 
there are online trainings too. you can go to
http://www.aps.anl.gov/Xray_Science_Division/Powder_Diffraction_Crystallography/GSASEXPGUI.html

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one Chinese guy is giving some advice, in  a funny way.  Hope you heard of google translate; I 'll translate some of the sentences when feel like doing it.
http://emuch.net/html/201110/3668889.html

关于精修,我想说的是,一定要知道X射线晶体学的一些理论知识,如果对XRD的认知仅仅停留在会对照PDF卡片定性分析,建议暂时不要入手精修,先闭关修炼一段时间再来入手。 
我的经验是这样的:一年前,我对XRD的认知就是会定性分析,用下jade,highscore什么的。偶然的机会下了GSAS,弄了两下,一头雾水。 后来,知道了倒易空间,布拉菲点阵啊,32点群,230对称群,11laue群啊什么的,(虽然不精通,但至少知道怎么回事)。 后来再用了下GASA,半天搞定,后面又用了一两天 搞定了 fullprof,muad,topas(都是触类旁通)。 现在完全可以用这些软件进行精修。

这些软件原理基本一样,但各有特色:

GSAS和fullprof名气应该很大,个人觉得GSAS的择优取向校正 多了 sphere harmonic函数,这个函数校正择优取向很有效,fullprof虽然提供了4中择优校正函数,但是都要自己输入择优方向,而harmonic只要选择阶数和laue群就行,对一些取向不是特别明显 或者通过谱图,无法肉眼判断择优方向时,很有效。【JZ: both GSAS and fullprof are famous; but personally I think GSAS used spherical harmonic function for orientation correction, which is very effective.  On the other hand, fullprof provides four different orientation corrections, but you have to select which direction is the preferred orientation.  Spherical harmonic correction needs only two inputs, the order number and laue, and it's useful for samples hard to judge which direction is the preferred direction 】而GSAS的微结构分析方面个人觉得比fullprof差(也或许是我不会,呵呵),fullprof 提供 了 各项同性和各向异性的 晶粒大小和 微观应变的 模型,只要提供 irf文件,就可以进行 WH和WA 的分析,非常方便。(但是对微结构的分析 我还推荐一个专门软件:MarqX和PM2K,这两款款是同一个组编写的,PM2K界面要友好,都是免费软件,只是需要自己输命令,比较麻烦,但做微结构分析,这绝对是很好的软件)。
再来说说maud,可能有些人不熟,但却是很好用。这里面提供一个向导,就是说你只要点一个键,就可以完成精修,很傻瓜式,但是要得到好的结果,只用向导肯定是不行的。但是不用向导就比较麻烦,因为各个参数全部在一个叫parameter list的树形目录里,不是按钮模式,是文字模式,可能 对不懂理论的人 就傻眼了。 不知道写的是什么。但是内行,应该很看出 大部分参数的意义。这个软件 对择优取向的模型非常多,harmonic里 提供了 11个lau群( 而GASA里 好像只有 3个?反正很少),而且能画出彩色极密度图,非常方便。对微结构分析至少比GSAS方便。只是峰形函数只有一个,没有GSAS和fullprof多。

那个最后一个就是topas了 我用的是 academic版, 所以运行起来麻烦, 总体感觉跟GSAS差不多,择优取向 也有harmonic函数,但是 好像 背景不能自己加点。 但是有个问题:可能是这个收费软件 即便是academic版,我用的是破解版,输入 AlOOH模型时,计算的向相对强度 始终不对,我检查了占有率和温度因子,好像都没错误,不知道为什么?  是不是破解版缺少了 什么东西,或者是原子的散射因子 数据库有问题?  反正不推荐使用,因为在精修方面 ,它能做的 上面三款 都能做, 而且 它还是收费软件,强烈不推荐。

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